蓝沙专利 | 对被污染样品进行亲子鉴定的生物信息处理方法

2024.08.26 责任编辑:陈醒 阅读量:264

专利名:对被污染样品进行亲子鉴定的生物信息处理方法
对被污染样品进行亲子鉴定的生物信息处理方法.jpg 775.9 KB

本发明公开了一种对被污染样品进行亲子鉴定的生物信息处理方法。本发明专利可以解决亲子鉴定中样品交叉污染的问题,即使一方检材被另一方检材污染高达 99%,本发明专利依然可以准确识别两个检材是否符合亲子关系。用本发明专利,可以大幅提高检材的可用率,特别是对一些特殊条件下获取的珍贵检材,即使其存在交叉污染,也依然可以通过本专利方法进行亲子关系鉴定。
亲子鉴定是基因检测技术非常成熟的应用领域,一般通过检测两个检材的遗传标记,对两个样品的检测结果进行比对,如果两个样品的遗传标记符合孟德尔遗传定律,则认为两个样品符合亲子关系。

目前常用的遗传标记主要有两种,短序列串联重复 (STR) 和单碱基多态性位点 (SNP)。一代测序技术一般通过 21 个 STR 位点来进行亲子鉴定判别,具有速度快、成本低和操作简便等优势,被各类的鉴定机构广泛使用。
但 STR 位点容易出现突变,并且在进行 PCR 扩增的过程中也容易产生低频错误噪音,再加上一代测序本身的技术限制,如果检材出现被污染的情况,特别是当污染源占到了检材的大部分信号,而真实的检材只占了小部分信号的情况下,基于 STR 的一代亲子鉴定检测方法很难对此类样品进行准确地检测。特别是当两个检材中,有一方被另一方严重污染的情况下,传统的一代测序无法采用该检材用于亲子鉴定,甚至容易给出错误的鉴定结果。

在现实中,进行亲子鉴定的双方,经常会有一方(如父亲或母亲)为另一方(比如孩子)采样的情况,从而导致被检双方样本的交叉污染,有时甚至会出现污染信号大于真实检材本身信号的情况。这种情况下,一代鉴定技术无法判断结果,只能要求送检方重新送样,提供未被污染的样本重新检测。

本发明专利采用二代测序技术,并通过特有的生物信息学分析以及数理统计算法,成功地解决了上述问题。即使一方检材被另一方检材污染高达 99%,本发明专利依然可以准确识别两个检材是否符合亲子关系。用本发明专利,可以大幅提高检材的可用率,特别是对一些特殊条件下获取的珍贵检材,即使其存在交叉污染,也依然可以通过本专利方法进行亲子关系鉴定。
一代亲子鉴定与二代亲子鉴定对比.png 45.8 KB

蓝沙生物作为基因检测行业的专精特新企业【2023年上海市专精特新中小企业名单(第二批)】,致力于采用对DNA、RNA、蛋白定量的生物学检测技术以及高性能计算方法,为客户提供精准、可靠的医学检验产品和服务。
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DNA鉴定

根据孟德尔遗传定律(亲子鉴定的理论基础),孩子身上的遗传物质一半来自于生物学父亲(简称“生父”),一半来自于生物学母亲(简称“生母”),每个基因座上的两个等位基因也分别来自生父和生母。DNA亲子鉴定就是根据科学技术将子女的DNA信息与父亲、母亲的DNA信息相比对,如果符合即是亲生关系,不符则非亲生。

向广大社会公众提供准确、可靠的亲子关系鉴定服务。蓝沙实验室采用高通量测序技术,并配备市面先进检测设备;为确保结果的准确性,实施了包含样本质检、生产质检、报告质检三层质检流程,结合生物信息分析与计算机数据分析技术,对检测过程进行严格的质量监控和比对,确保每一位客户都能得到精确可靠的鉴定结果。